在線編程目前有兩種實現(xiàn)方法：在系統(tǒng)編程（ISP）和在應用編程（IAP）。ISP一般是通過單片機專用的串行口對內(nèi)部的整個Flash存儲器進行編程,而IAP技術是從結構上將Flash存儲器分為兩個部分,當運行一個存儲體上的用戶程序時,可對另一個存儲體重新編程,之后將控制從一個存儲體轉(zhuǎn)向另一個。而IAP的實現(xiàn)更加靈活：通常可利用單片機的串口，網(wǎng)口，USB等接口在線編程，從而實現(xiàn)代碼的遠程升級。
有些用戶希望產(chǎn)品在實際應用期間能夠通過某種遠程通信方式自動地更新程序內(nèi)容，顯然ISP已經(jīng)無法滿足這樣的需求了。新出現(xiàn)的IAP燒錄方式為程序的自我更新提供了有效手段。單片機內(nèi)部的Flash存儲器保存有用戶的程序代碼，這些代碼在正常運行期間是不能被修改的。但是有了IAP，用戶程序就能夠根據(jù)需要（滿足某種條件）自行修改部分甚至全部程序代碼。新的程序代碼可能是程序在運行過程中自動生成的，也可能來自于遠程設備。

Boot代碼必須通過其它手段，如JTAG或ISP燒入；APP代碼可以使用Boot代碼的IAP功能燒入，以后就可以方便地利用IAP功能更新代碼了。 　
這兩部分代碼存放在FLASH的不同地址范圍，一般從最低地址區(qū)開始存放Bootloader，緊跟其后的就是APP程序（注意，如果FLASH容量足夠，是可以設計很多APP程序的）。