核酸自動(dòng)提取儀有哪些分類?影響核酸提取的因素有哪些?
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以下內(nèi)容中,小編將對(duì)核酸自動(dòng)提取儀的相關(guān)內(nèi)容進(jìn)行著重介紹和闡述,希望本文能幫您增進(jìn)對(duì)核酸自動(dòng)提取儀的了解,和小編一起來看看吧。
一、核酸自動(dòng)提取儀及其分類
核酸自動(dòng)提取儀又名核酸自動(dòng)純化儀,是應(yīng)用配套的核酸提取試劑,來自動(dòng)完成樣本核酸提取工作的儀器。廣泛應(yīng)用在疾病控制中心、臨床疾病診斷、輸血安全、法醫(yī)學(xué)鑒定、環(huán)境微生物檢測(cè)、食品安全檢測(cè)、畜牧業(yè)和分子生物學(xué)研究等多種領(lǐng)域。
1.根據(jù)儀器型號(hào)大小不同劃分
自動(dòng)液體工作站:自動(dòng)液體工作站是功能非常強(qiáng)大的設(shè)備,液體分液、吸液等自動(dòng)完成,甚至能通過整合擴(kuò)增、檢測(cè)等功能,實(shí)現(xiàn)標(biāo)本提取、擴(kuò)增、檢測(cè)全自動(dòng)化。大型自動(dòng)液體工作站因?yàn)樵O(shè)備成本高昂,運(yùn)行成本高,適合一次提取幾千個(gè)同一種類標(biāo)本,所以真正得到應(yīng)用的比較少。
小型自動(dòng)核酸提取儀:利用封裝好的配套試劑自動(dòng)完成提取純化過程;小型自動(dòng)化的儀器,因?yàn)閮x器設(shè)備和運(yùn)行成本低,操作方便得到越來越多的應(yīng)用。
2.根據(jù)提取原理不同劃分
離心柱法的儀器:離心柱法核酸提取儀主要采用離心機(jī)和自動(dòng)移液裝置相結(jié)合的方法,通量一般在1-12個(gè)樣本,操作時(shí)間和手工提取相差無幾,不能提高實(shí)際工作效率,且價(jià)格昂貴,不同型號(hào)儀器的耗材也不能通用。
磁珠法的儀器:以磁珠為載體,利用磁珠在高鹽低PH值下吸附核酸,在低鹽高PH值下與核酸分離的原理,再通過移動(dòng)磁珠或轉(zhuǎn)移液體來實(shí)現(xiàn)核酸的整個(gè)提取純化過程。由于其原理的獨(dú)特性,所以可設(shè)計(jì)成很多種通量,既可以單管提取,也可以提取8-96個(gè)樣本,且其操作簡(jiǎn)單快捷,提取96個(gè)樣本僅需30-45min,大大提高了實(shí)驗(yàn)效率,且成本低廉,是目前市場(chǎng)上的主流儀器。
二、影響核酸提取效率的因素
一般核酸提取的主要步驟分為四步:裂解、吸附、洗滌和洗脫,每一步出現(xiàn)問題都會(huì)影響磁珠的提取效率。下面就具體介紹一下影響核酸提取效率的一些因素。
1、樣本裂解是裂解細(xì)胞或病原體,釋放里面的核酸。影響裂解的主要因素有裂解液的成分及裂解的溫度和時(shí)間。
裂解液成分:對(duì)于一些難裂解的樣本,可以通過提高胍鹽濃度以及表面活性劑濃度來增強(qiáng)裂解液的裂解能力。
裂解溫度和時(shí)間:提高溫度和增加裂解時(shí)間可以讓細(xì)胞裂解更徹底,得到更多核酸,需要摸索合適的溫度和時(shí)間;溫度過高或時(shí)間過長,也有可能導(dǎo)致核酸斷裂或醇類揮發(fā)導(dǎo)致的提取效率下降。
2、吸附是磁珠吸附核酸的能力,影響吸附能力的有磁珠的吸附能力以及結(jié)合緩沖液的結(jié)合能力。磁珠吸附能力受到磁珠比表面積以及修飾基團(tuán)的密度影響??筛鶕?jù)實(shí)際樣本選擇磁珠粒徑和修飾基團(tuán)。
自動(dòng)核酸提取儀
3、洗滌是去除DNA以外的RNA、蛋白質(zhì)等雜質(zhì)。關(guān)系到核酸的純度,磁棒的振蕩幅度和混合時(shí)間會(huì)影響洗滌效率。磁棒振蕩幅度太小或混合時(shí)間太短,有雜質(zhì)殘留在磁珠上會(huì)影響磁珠吸附核酸的能力。振蕩太劇烈或時(shí)間太長,會(huì)丟失部分核酸或造成核酸的斷裂、降解,得率下降。
4、 洗脫是解離吸附在磁珠上的DNA,得到純度和濃度均很高的DNA,直接影響核酸得率,影響洗脫效率的因素有磁珠的干燥程度以及洗脫溫度和時(shí)間。磁珠未充分晾干,可能會(huì)有醇類等雜質(zhì)殘留,影響后續(xù) PCR 反應(yīng);磁珠過分干燥,核酸可能會(huì)干結(jié)在磁珠上,導(dǎo)致洗脫效率下降。適當(dāng)提高洗脫溫度和時(shí)間,有利于核酸從磁珠上游離下來,時(shí)間過長或溫度過高,核酸有可能會(huì)降解,需要把握其中的平衡。
全自動(dòng)核酸提取儀能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)化、高通量操作,適用于疾病控制中心、臨床疾病診斷、輸血、出入境檢驗(yàn)檢疫、食藥監(jiān)、法醫(yī)學(xué)鑒定、環(huán)境微生物檢測(cè)、食品檢測(cè)、教學(xué)、科研、畜牧業(yè)和分子生物學(xué)研究等多種領(lǐng)域,尤其是對(duì)各地區(qū)爆發(fā)疫情需大規(guī)模核酸檢測(cè)起著至關(guān)重要的作用。
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